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实验介绍


一、实验简介

PCR(聚合酶链式反应)及其衍生技术(qPCR、RT-qPCR)是分子生物学中用于核酸(DNA/RNA)体外扩增与检测的核心技术。三者均基于DNA双链复制原理,通过引物特异性结合靶序列,利用 DNA 聚合酶实现目的片段的指数级扩增,最终实现对靶核酸的定性或定量分析。作为基因研究的基础工具,这些技术广泛应用于基因表达分析、病原体检测、基因型鉴定等场景,是从 “核酸样本” 到 “基因信息” 的关键转化手段。

1.普通 PCR(定性PCR)

核心功能:通过扩增特定 DNA 片段,实现靶序列的定性检测(如 “是否存在某基因”“片段大小验证”)。

技术特点:无荧光检测模块,需通过琼脂糖凝胶电泳观察扩增产物的有无及大小,适合快速验证或初步筛选。

2. qPCR(实时荧光定量 PCR)

核心功能:在 PCR 扩增过程中,通过荧光信号实时监测产物量,实现对初始 DNA 模板的定量分析(绝对定量 / 相对定量)。

技术特点:无需电泳,直接输出定量结果;通过溶解曲线分析可验证扩增特异性,结果更精准。

3. RT-qPCR(反转录 实时荧光定量 PCR)

核心功能:以 RNA 为初始模板,先经反转录合成 cDNA,再通过 qPCR 定量,最终反映基因的转录表达水平(mRNA 丰度)。

技术特点:整合反转录与 qPCR 步骤,是研究基因表达差异的 “金标准”,可区分基因在不同组织 / 处理下的活性变化。


二、核心应用场景

技术类型

典型应用

普通 PCR

质粒 / 载体构建后的插入片段验证

基因分型(如 SNP 检测初步筛选)

病原体定性检测(如病毒 / 细菌是否感染)

qPCR

病原体载量定量(如病毒拷贝数计算)

基因拷贝数变异(CNV)分析

转基因生物的目的基因拷贝数检测

RT-qPCR

不同组织 / 细胞中基因表达量差异分析(如肿瘤 vs 正常组织)

药物处理后基因上调 / 下调验证

非编码 RNA(miRNA、lncRNA)表达分析


三、实验流程与周期

共性流程:样本接收→核酸提取(DNA/RNA)→引物设计与验证→扩增体系优化→实验检测→结果分析

分述周期:

普通 PCR:5-7 个工作日(含电泳验证)

qPCR:7-10 个工作日(含标准曲线制备、复孔重复)

RT-qPCR:8-12 个工作日(含 RNA 质量检测、反转录步骤)


四、客户需提供的样本信息

1. 样本类型

组织样本:新鲜 / 冷冻组织(动物、植物、微生物)、石蜡包埋组织(FFPE)

体液样本:血液(EDTA / 肝素抗凝)、血清、血浆、脑脊液、尿液等

核酸样本:已提取的 DNA(浓度≥5ng/μL)或 RNA(浓度≥10ng/μL,RIN 值≥7.0)

2. 样本要求细则

组织样本:重量≥50mg(动物)/100mg(植物),-80℃冷冻保存,避免反复冻融;FFPE 样本需提供≥5 片(厚度 5-10μm),附带病理诊断信息。

体液样本:血液≥2mL,血清 / 血浆≥500μL,需 4℃冷藏运输(超过 24 小时需干冰)。

核酸样本:需提供浓度、纯度检测报告(如 Nanodrop 数据),RNA 样本需注明是否去除基因组 DNA。

其他:需提供靶基因名称、物种信息(如人 / 小鼠 / 大鼠),若有指定引物需提供序列及验证报告。


五、交付内容及增值服务

1. 基础交付:

实验报告(含详细流程、试剂品牌、仪器型号)

原始数据(如电泳图片、qPCR 原始 Ct 值、溶解曲线)

样本剩余物(若客户需要,可冷藏保存 1 个月)

2. 增值分析:

qPCR 定量结果:绝对定量(拷贝数 /μL)或相对定量(2^-ΔΔCt 法计算的表达倍数),附统计学分析(标准差、P 值)。

可视化图表:扩增曲线、溶解曲线图、表达差异柱状图 / 折线图(可按需调整图表格式)。

结果解读:针对异常结果(如扩增效率低、非特异性峰)提供可能原因分析及后续建议。


六、技术优势

仪器保障:采用 ABI QuantStudio 6 Flex 实时荧光定量 PCR 仪,检测灵敏度达 10 copies/μL,线性范围覆盖 7 个数量级。

质控体系:每批次实验设置阴性对照(无模板)、阳性对照(已知浓度标准品)、3 次技术重复,确保 CV 值<5%。



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